Was ist eine LOD Kerbe?

Eine LOD Kerbe ist eine Darstellung der Wahrscheinlichkeit eines Gestänges zwischen zwei genetischen Merkmalen. Wenn die LOD Kerbe hoch ist, bedeutet es, dass die Merkmale nah verbunden werden, und folglich normalerweise zusammen übernommen. Niedrige Kerben zeigen einerseits ein niedriges Gestänge an. Ist reicht LOD versteht Kerben zu den Genetikern aus einigen Gründen wichtig und vom Wunsch, bestimmte genetische Bedingungen zu einem Wunsch zu verstehen, wo ein Gen lokalisiert wird, using Informationen über bekannte Gene herauszufinden.

Um den Wert der LOD Kerbe zu verstehen, hilft es zu wissen dass die genaueren zwei Genorte miteinander sind, ist es das wahrscheinlicher dass sie wird übernommen zusammen. Wenn Gene auf verschiedenen Chromosomen z.B. sind werden sie normalerweise separat übernommen, weil viel Überkreuzung während der Verkleinerung auftreten kann. Wenn Gene auf dem gleichen Chromosom, aber weit auseinander sind, werden sie auch normalerweise unabhängig übernommen. Wenn Orte in der nächsten Nähe auf dem gleichen Chromosom jedoch sind neigen sie, zusammen übernommen zu werden. Diese Informationen sind an der Wurzel der LOD Kerbe.

LOD steht für “logarithm der Vorteile, das †, welches die Tatsache reflektiert, dass die Zahl logarithmisch ausgedrückt wird. Als allgemeine Regel wenn die LOD Kerbe drei oder höheres ist, bedeutet es, dass es eine hohe Wahrscheinlichkeit des genetischen Gestänges gibt. Niedrigere Zahlen zeigen weniger Wahrscheinlichkeit des genetischen Gestänges an, obgleich sie bei Beseitigung nützlich noch sein können.

Um eine LOD Kerbe festzustellen, ist eine Datenprobe erforderlich. In dieser Art der statistischen Analyse, das grösser die Probe, das bessere. Die Forscher, die mit Organismen wie Fruchtfliegen arbeiten, können eine Bevölkerung aktiv züchten, um herauszubringen, oder gewünschte Merkmale mit dem Ziel das Studieren der LOD Kerbe für spezifische Merkmale unterdrücken, während mit Bevölkerungen wie Menschen, Forscher auf den Daten sich begrenzen müssen, die durch Beobachtung gesammelt werden. Große Proben neigen, sinnvolle Informationen statistisch zu erbringen, weil sie das Risiko der Plattfische und der Blöcke verringern, die die Daten verdrehen.

Using Daten von einer Bevölkerung des Interesses, betrachten Forscher, wie oft die Merkmale des Interesses zusammen auftreten und wie oft sie separat auftauchen. Diese Informationen werden verwendet, um zu der Rekombinationfrequenz zu kommen und betrachten, wie oft genetische Merkmale wiederverbinden. Um auf dem gleichen Chromosom zu sein, muss die Rekombinationfrequenz kleiner als 50% sein, und sie muss sogar es ablehnen anzuzeigen dass Orte miteinander nah sind. Sie analysieren diese Informationen, um festzustellen, wie wahrscheinlich es ist, dass es ein genetisches Gestänge gibt, und wie wahrscheinlich es ist, dass es nicht ein genetisches Gestänge gibt. Die LOD Kerbe wird festgestellt, indem man die Wahrscheinlichkeit des Gestänges durch die Wahrscheinlichkeit ohne Gestänge teilt. Gewöhnlich werden LOD Kerben für mehrfache Orte berechnet.